此后不久,造反派内部出现分歧,逐步分割成两大派别“总站派”和“兵团派”,互相以正统造反派自居,攻击对方。作为山西驻军的负责人,谢振华成了“救火队员”。混乱一直持续到1969年,中共九大召开。毛泽东评价山西局势,要求解决山西问题。随后中共中央发布了解决山西问题的《七二三布告》,要求立即停止武斗,缴纳武器。谢振华担任中共山西省委核心小组组长,随后被选为山西省委第一书记兼革委会主任、山西省军区司令员。正式开始主持山西党、政、军全面工作。
随后,他率部制止大规模武斗,恢复工农业生产,在他的带领下,山西局面恢复正常。