1934年4月28日，广昌失守，当晚，中革军委主席朱德在广昌召开会议，总结广昌失利的教训，讨论下一步计划。主要与会人员有：博古、李德、朱德、顾作霖和各军团领导。王耀南从红校工兵系主任调到中央军委担任工兵参谋，和武亭、聂鹤亭作为会议服务人员，也参加了会议。

    1934年5月初，中共中央书记处在瑞金召开了会议。

    中共中央总书记博古提出“北上抗日”的口号。博古、共产国际顾问李德和周恩来，决定将红军主力撤离中央苏区，转移到湘西，得到书记处批准，并将这一决定报请共产国际批准。

    会上，红三军团军团长彭德怀建议：红军跳出堡垒合围，到江、浙、苏、杭一带开展游击战。

    1934年7月6日，张闻天同意彭德怀的建议，指示中央军委派红7军团从瑞金出发，进军福建。12月，红7军团与红10军团一起在安徽全军覆灭，只有粟裕率领800多人突围成功。彭德怀建议的这条路走不通。

    周恩来建议萧克的红6军团到湘西与红2军团贺龙部（当时叫红3军）会师，探探路，看看从湘西这条路突围是不是能走通。1934年8月7日，红6军团顺利达到湘西与红2军团会师。中央于是决定：中央红军也从湘西突围与红2、红6军团会师。1934年8月中旬，中央准备开始长征。

    1934年5月，王耀南参加了第五次反围剿失败原因的调研。最后，他给中央书记处写了一个报告，总结第五次反围剿失败的原因，主要内容如下：

    1，经济上蒋介石把国家收入百分之40—46用于围剿红军。
    2，蒋介石实行了保甲制度，把红军和老百姓隔离开来。
    3，敌人力量过于强大。

    从1933年10月17日开始，蒋介石用于进攻中央苏区的兵力75个师和9个独立旅，达92万人，200架飞机、1500门重炮。红军只有3万多支步枪，红军人数不到5万，双方实力相差悬殊。

    蒋介石出身贩盐世家，他明白控制了盐就控制了经济，第五次围剿开始，蒋介石严禁食盐进入苏区，苏区一个袁大头只能买到一两盐，现在的盐是有价无货，有个笑话，有人抢了一粒盐，老板追过3条街。没有盐，战士们连路都走不动。

    1934年6月周恩来派王耀南和张明远去湘西调查。王耀南负责了解沿途的河流情况，提出架桥计划方案。张明远负责了解沿途的疾病流行情况。周恩来还嘱咐二人要注意秋粮收获情况，王耀南知道这是为长征做准备。他们两人从湘江渡口侦察回来，王耀南汇报：从于都到湘江之间有于水、信丰河、章水、钟水、潇水、灌江等几条河，都容易渡过, 只有渡湘江比较困难。湘江有4个渡口：1.界首渡口宽80米，水深6米，只能架桥；2.凤凰嘴渡口，上游约300米处，筑有灌溉用的堰坝，当地人叫董家堰，江面宽1200多米，水深1到1.3米可涉渡；3.屏山渡口河面宽约60米，水深4米，只能架浮桥，屏山渡口下游300米处有一堰坝，水深1.3米可涉渡；4.大坪渡口上游500米处有一堰坝，水深1.2米，可涉渡，但江面较宽阔。

    王耀南、张明远刚汇报完工作就被保卫部扣押了。原来，红军派到江浙的两名侦查员，假扮成国民党军官，在杭州强奸了一对姐妹。经保卫部审判后执行枪决，全军震动，（这件事1973年出版李德《中国纪事》有记载）。保卫部经过审查没有发现王耀南和张明远有违反纪律的行为，予以释放。红军又重新颁布，“三大纪律，八项注意”，所有的红军干部在这次事件中受到深刻的教育。红军长征之所以能败而不溃，不但因为有建立新中国的理想，而且有严格的纪律，对老百姓秋毫无犯。

    广东军阀陈济棠知道老蒋想让他与红军火拼，消耗双方的力量，老蒋从中取利。陈济棠为保存实力，希望红军快点离开广东。1934年9月下旬，陈济棠主动通过秘密渠道，给周恩来写了一封亲笔密函，派密使前往瑞金与红军秘密谈判。陈济棠同意借路让红军通过他的防区西行。陈济棠采取了“敲梆式的堵击，送行式的追击”，红军顺利通过3道封锁线。

    长征要过的第一条河是于都河，人民委员会主席张闻天任命中央苦力部长王中仁在于都河指挥架桥。王中仁组织了一个架桥领导小组，开始设计图纸、准备材料、聘请工匠，王中仁还组建了一个兵工营，由民兵队长韩连生担任营长，到武夷山去砍伐木材。这个小组准备了一个月，图纸还没有设计出来。

    共产国际军事顾问李德只好亲自指挥架桥。红军第四次反围剿战役中，国民党中央军第9师、第11师、第52师、第59师的工兵营人员，全部被红军俘虏，其中有何涤迪等4名少校工兵营长。李德任命何涤迪等4名少校工兵营长，担任助手。这4个工兵少校都是浙江人，是蒋介石同乡，都曾经按了红手印，宣誓：“不成功则成仁”，绝不投降。现在，投降了，他们回到国民党部队就要被枪毙。红军总参谋长刘伯承安排他们在红校当工兵教员，想改造他们（抗战时，他们4个人都回到国民党部队进行反共工作）。

    李德指挥架桥。按照德国标准，20天绘出了军用浮桥图纸，浮桥的连接件需要用高强度、高韧性的钨钢、镍钢。这些材料只能到上海订货。一直到10月7日，李德的于都架桥还是纸上谈兵。

    1934年9月14日，中央召开政治局书记会议，（书记博古、政治局委员周恩来、张闻天、陈云、项英参加会议。后补委员朱德、李维汉列席，毛泽东请假）。会议决定成立“最高三人团”，由博古、周恩来、李德组成。会议决定：10月底突围到湘西，与红2军团，红6军团会合，成立湘西革命根据地。三人团下设作战科，作为“最高三人团”的参谋。聂鹤亭任科长，负责中央作战计划的传达和反馈；武亭任科员负责了解部队火力配置；王耀南任科员负责指挥架桥并指挥部队过桥。

    周恩来要王耀南调查部队实力，经王耀南调查：从1933年9月25日，蒋军进攻黎川，红军开始反围剿，到1934年10月14日结束。历时363天。战斗27次。红军伤亡17134人，其中4000人阵亡、1500个重伤员、4500多轻伤员。要转移的红军部队有32243支枪、651件轻重机枪、有38门迫击炮、5门山炮。携带180万发子弹、2523发迫击炮弹和76526颗手榴弹。202万块银元，17吨盐（每两售价一块现洋）、200万斤大米，10万套棉衣，携带了6101根梭镖、882把大刀。红军从6万人扩编到86859人（其中包括有4500个轻伤员）。随部队行动的还有30名机修厂工人、1.5万名民工（主要抬架桥渡河的器材）。

    1934年9月下旬，蒋介石的首席军事顾问、德国人赛克特制定了“铁桶计划”：计划集结100万大军、270架飞机和200门大炮，“分进合击”“铁壁合围”，对中央红军进行围剿。以瑞金为目标，各部队实行向心攻击，在距瑞金150公里处形成一个大包围圈。计划每天攻击前进5公里后，就修筑碉堡工事，严密进行火力配备。在瑞金四周构建起30道铁丝网和火力封锁线。断绝交通，封锁红军的一切信息和物资来往，最后将红军主力压迫到狭小范围歼灭。   

    江西赣北保安司令莫雄参加了庐山军事会议，他将“铁桶计划”交给了保安司令部谍报科参谋项与年。项与年为给红军送情报，一连敲掉了4颗门牙，装成乞丐，混过了沿途敌军的层层哨卡，于10月7日下午到达瑞金城，把“铁桶计划”交给周恩来。中央原来计划10月底突围到湘西，与红第2，第6军团会合。由于军情突然变化，红军决定提前，10月10日开始突围。

    朱德总司令把红军所有的工兵都调到于都架桥，他命令王耀南在于都河指挥架桥。王耀南带着工兵营从前线赶到于都城，周恩来在于都河边，王耀南看见李德对着周恩来哇啦哇啦，说个没完。翻译王智涛说：李德顾问说，没有水泥，没有钢板，苏区工厂没有加工能力...。周恩来面无表情对王智涛说：你告诉李德顾问，顾问同志辛苦了，可以回去休息了。

    周恩来任命王耀南担任架桥总指挥，要求王耀南5天内架好5座桥。于都河宽605米，最深的地方5米左右。

    李德指挥红军进行第5次反围剿，黎川反击战、筠门岭保卫战、广昌保卫战，连打败仗。李德把打败仗的责任全部推给了红军干部。441个师、团、营干部受到处罚。周恩来把这些干部交给王耀南安排在工兵营，保护并锻炼这些干部，将来好担负重要工作。王耀南把他们编成一个工兵连，王耀南兼任这个连的连长。

    这些干部在红校学习时是王耀南的学生，与王耀南比较熟悉。王耀南看见大家垂头丧气，说：“打了败仗，责任在上面，你们也有责任。现在停职，有机会总结工作，应该高兴才对。周副主席要求你们，每天进行沙盘演习，互相学习、讨论，我给你们当裁判。”王耀南看了原第22师政治部主任刘道生一眼说：“22师在筠门岭那么好的阵地不守，搞什么‘诱敌深入’！红军第1,2,3次反围剿是采取诱敌深入，第4次反围剿就采取了声东击西。战略战术要根据地形、敌情、敌我力量变化而变化。你想想看，22师都是新兵，离开坚固的筠门岭阵地，敌人在后面一放枪，哪有不跑的道理。”张南生说：“王连长说的对。”其实刘道生很冤枉，他替别人说了一句公道话，就被撤职，罗荣桓替他求情，被撤成巡视员。

    江西省从太平天国开始，战乱就没有停止过。安源煤矿修铁路的枕木、煤矿用的支撑木、城里盖房子用的木材，用的都是用江西本地的木材。因此，要在于都河上架桥，已经没有可用的木料、也没有袁大头给工人发工钱。于都河上只有十几条小渔船，还有几只摆渡船。

    巧媳妇难为无米之炊。好在王耀南注意到，当地有大片竹林，河岸堆满了中央苏区没有卖出去的钨砂。王耀南用钨砂当工钱（钨砂很贵，可以当袁大头使用），用一个个竹排连起来当浮桥。红军工厂生产了锚和伐竹子的锯子。不一会，一个老大爷和工兵连长郭斌吵了起来，工兵连指导员张永清和副连长黄朝天去劝说都没有用。王耀南只好去解决。原来，这位曾大爷两个儿子都参加了红军，现在把自己的棺材板捐了出来，不肯收钱。王耀南拿着一袋钨砂说：你儿子是英雄，这些钨砂是他们的奖品，你生活得好，你的儿子会立更大的功劳，曾大爷拿着钨砂高高兴兴地走了（于都当地流传的长征故事记载了王耀南这件事）。

    10月10日下午，王耀南指挥工兵在龙门前、塔脚下、水南中坝、水南上坝和门坎石架好了5座浮桥。10月10日开始，中央红军86789人、5门75毫米山炮，平安渡过了于都河，王耀南对浮桥的质量放心了。

    毛主席走过了浮桥，用脚使劲跺了跺浮桥，问王耀南：先头两拨人为什么一个多月都没有架成浮桥，你却只用5天就架成了5座浮桥？王耀南说：他们的目标是架桥，我的目的是把红军送过河。毛主席又问：你们有没有违反群众纪律？王耀南回答：我们一切都是按照三大纪律八项注意做的。毛主席点了点头。

    最后是张闻天率领的政府部门过河。张闻天把红星报的石印机，银行的2台铸币机，10个碾米的石滚子，石磨...连桌椅板凳都带上了。王耀南说：周恩来3次下令：“笨重设备一律不许带。”常委排名第二的张闻天，地位比周恩来高，不听周恩来的命令，王耀南没有办法，只好让他们通过。

    徐特立57岁参加长征，他拿着一根红缨枪，一步步走完了长征路。

    红军将士擦干净身上的血迹，掩埋好同志们的遗体，举着红旗渡过于都河，开始了震惊世界的两万五千里长征。中国革命开启了新篇章。

    共产国际顾问李德，第五次反围剿，他向中国的领导人建议用堡垒对堡垒，结果，留苏派葬送了中央苏区。