十一届三中全会后，中央确定调整国民经济的方针，一些拟兴建的大型项目下马。对于建设总投资达214亿元的上海宝山钢铁总厂是不是应该搞下去，产生了不同意见。1979年6月，陈云戴着那顶安全帽，亲自到上海宝钢建设基地进行实地考察。同月16日，他主持国务院财政经济委员会全体会议，专门讨论宝钢建设问题。会上，陈云指出：宝钢是一个特大项目，事关全局，上了马就干到底，举棋不定不好。在陈云和国务院财经委员会的主持下，宝钢的建设确立并实施了符合实际的科学思路和方针。1985年9月，宝钢胜利建成投产。

    1991年5月，陈云在上海听取了时任国务院副总理朱镕基、上海市委书记吴邦国、上海市长黄菊等同志关于上海市改革开放、市政建设等有关工作的汇报后，陈云将亲手书写的“不唯上、不唯书、只唯实，交换、比较、反复”的条幅，分送给朱镕基、吴邦国、黄菊。

    第二年的4月，陈云在上海听取吴邦国、黄菊关于上海工作情况的汇报后，高兴地说，“上海大有希望。”陈云还笑着对黄菊说：“不是有新闻记者向你打听陈云对开发开放浦东的态度吗？你回答得很好，我非常赞成开发浦东，开放浦东！”

    1995年4月初，已经卧床多日的陈云想散步。因为不便说话，他给身边的工作人员写字条：“下床散步。”然后，他提出，想听听上海人民广播电台录制的评弹《闯王进京》。当时北京没有这盘带子，身边工作人员马上给上海有关方面打电话，请他们尽快送来。

    4月9日，陈云听完早新闻后，工作人员按照他的意愿给放了一盘评弹录音带，名为《一往情深》。他静静地听着，神态很安详。《一往情深》是上个世纪80年代初上海评弹团创作的中篇评弹，讲述了一对青年恋人反抗世俗偏见、终成眷属的故事。1983年11月28日，陈云曾写信给上海评弹团团长吴宗锡，称赞这部书：“《一往情深》是一个极好的中篇，我已听了十几次。”

    4月10日下午二时，陈云的心脏停止了跳动。《闯王进京》的带子送到了，但这段来自上海的乡音，陈云没能听见。

    陈云将内脏器官献给了祖国的医学事业。按照陈云家属的愿望，陈云的骨灰撒在八宝山革命公墓一株雪松下。一切，如他生前所希望的那样进行，也一如他生前练习书法时最喜欢抄赠别人的那首郑板桥的诗一样：

    新竹高于旧竹枝，

    全凭老干相扶持。

    明年再有新生者，

    十丈龙孙绕凤池。