北军政大学,兼任副校长。1949年5月,调任第四野战军兼华中军区第一参谋长,参与指挥部队南下,横渡长江,进军中南。他联络民主人士,组织策划河南张轸起义和湖南程潜、陈明仁起义,为武汉的顺利解放和湖南的和平解放作出了贡献。他参与指挥第四野战军千里追歼,席卷中南、西南,先后进行了6次较大规模的战役,歼灭了中南地区国民党白崇禧集团和余汉谋诸部共43万人,解放了湘、鄂、赣、粤、桂等省和海南岛,消灭了国民党军在大陆上的残存主力。
1950年6月,萧克同志任中央人民政府人民革命军事委员会军事训练部部长。他在组建军训部机关的同时,着重抓了筹建军事学院、组织编写军事条令和指导全军军事训练等主要工作。他亲自选定军事学院校址,挑选优秀军事指挥员担任教员。他提出了“三级制”院校培训体制,参与筹划创办了125所涵盖诸军兵种的各类军事院校,为我军院校正规化、现代化建设,做了大量开创性工作。他根据“统一指挥、统一制度、统一编制、统一纪律”的军队建设纲领,结合我军光荣传统,组织编写下发了纪律、内务、队列三大条令,有力促进了军队正规化建设。他针对部队参加抗美援朝战争后装备和兵种发生的变化,提出了“掌握新的技术,学会联合作战”的训练方针,得到了中央领导同志的充分肯定。他按照毛泽东同志关于要“开展正规训练,迅速提高人民解放军现代作战能力”的指示,领导制定了以战斗训练为主的正规训练计划,并先后组织或参与组织了明港诸兵种协同作战演习、南口战术演习、山东半岛和辽东半岛抗登陆演习,推动了部队战备训练工作,为部队组织大规模战役训练演习提供了有益的经验。
1954年11月,萧克同志任国防部副部长,1955年4月,兼任解放军训练总监部副部长,负责全军的教育与训练。1957年11月,任训练总监部部长。在1958年“反教条主义”运动中,萧克同志遭到错误批判,并被解除职务。1959年9月,调任农垦部副部长,他坚持原则,反对浮夸,纠正在橡胶种植工作中的冒进计划,先后主持制定了《国营农场工作条例》、《国营农场领导管理体制的决定》等40余项综合性和专业性规章,对加强和改善国营农场的管理起到了积极作用。“文化大革命”中,他受到林彪、江青集团的打击迫害。1969年冬,他遭受错误批判,被下放到江西“五七”干校劳动“改造”。在逆境中,他始终坚定信念,坚持学习,独立思考,不随波逐流,保持了共产党人的革命本色。
1972年5月,萧克同志被任命为中国人民解放军军政大学校长。他重返军队院校领导岗位后,夜以继日地投入工作,同其他校领导一起抵制“四人帮”的干扰破坏,狠抓领导班子、教员队伍和教材建设,全面整顿恢复了学校正规的教学工作秩序。1975年,他顶住“批邓”和“反击右倾翻案风”的压力,深入调查研究,先后提出了“治军必先治校”、“把教育和训练放在部队建设的首位”等主张,受到主持军委日常工作的叶剑英同志的充分肯定。在他主持军政大学工作的5年中,学校共开设12个班次,培训学员6600多名,为后来军队拨乱反正和新时期军队建设与发展培养了大批治军骨干。1977年12月,他任军事学院院长兼第一政治委员,后又任国防部副部长兼军事学院院长、第一政治委员。他带头破除“两个凡是”的思想束缚,坚持实事求是,大力平反冤假错案;坚持以教学为中心,恢复和发扬我军治校办学的优良传统。他非常重视师资队伍建设,采取各种措施,狠抓教研人员的学术水平和施教能力,营造尊师重教、讲求真才实学的风尚。他重视军事教学基础教材编写工作,先后主持编写了《第二次世界大战史》、全军第一部《战略学教程》,以及大量的协同作战战术教材、军兵种教材、政治教材、科技教材和全军通用的战术教材。他重视学术研究,组成学术委员会,确定研究方向和研
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