1928年4月，国民党蒋介石调集两个师，从两个方面向湘南苏区发起攻击。由于敌我兵力众寡悬殊，为了保持实力以利再战，朱德决定，暂时将队伍撤退到井冈山。他率领主力部队由耒阳经安仁、茶陵，向江西井冈山方向撤退，同时命令陈毅率领驻在宜章、资兴的农军和革命群众，从郴州、资兴、酃县向江西井冈山方向撤退。

    湘南起义表面来看，最终还是失败了，但这次起义为中国革命积累很多宝贵的实践经验，比如在敌强我弱的情况下开展游击战，建立了苏维埃政权和农民武装。李奇中认为：“湘南起义的重大意义在于：先有湘南起义和湘南十余县苏维埃政权的创建，然后，有井冈山会师和全国各地苏维埃政权的建立。”

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    4月28日，由朱德、陈毅率领的工农革命军第一师和湘南地方武装，同毛泽东领导的秋收起义队伍在井冈山胜利会师。

    5月4日，两军在砻市举行会师大会，决定合编为工农革命军第四军（6月改称工农红军第四军），朱德任军长，毛泽东任党代表，陈毅任政治部主任，王尔琢任参谋长。两支队伍会师后，势力大增，声威大震，井冈山革命根据地进入全盛时期。

    半个月后，鉴于井冈山人数暴增，粮草不足，朱德、毛泽东研究决定，湘南来的农军除了宜章县农军外，其余都返回原地打游击，开辟新的革命根据地。李奇中、黄义藻奉命率部回资兴龙溪，坚持游击战争达七八个月之久，开辟了龙溪游击区。1929年1月，国民党当局调集重兵围剿游击队，李奇中被迫潜往广州，却被广东国民党政府以“共产党嫌疑”逮捕，入狱三年，从此与党失去联系。

    1933年春，刚刚出狱的李奇中来到南京，在黄埔旧友帮助下，解决进入了津浦铁路技术改进会，做土木建筑工程工作。1934年秋，李奇中进入南京陆军大学特别班学习。

    1937年8月，李奇中从陆大毕业，时值卢沟桥事变刚爆发，立即投入到了抗日的洪流中，并先后在国民党军中担任诸多要职，被授予少将军衔。他利用自己的特殊身份，作了许多有益于革命的工作。抗战胜利前夕的1945年春，李奇中脱离国民党军队，举家迁往香港。在香港，他与共产党地下组织取得联系，以后便在李克农、吴志坚等的领导下，先后在上海、苏州为中共地下党组织搜集华东区军事情报，开展对敌策反工作，为中国人民解放军渡江战役、解放上海及华东地区立下了汗马功劳。为此，上海一解放，陈毅市长就约见了李奇中，感谢他为共产党所做的工作。

    1949年7月，李奇中应周恩来总理之召由上海到北平，参加全国政协筹备工作。1950年3月被任命为政务院参事，1954年任国务院参事，他积极调查研究，写出调查报告并对党和政府提出不少有益的意见和建议。同时多年潜心研究毛泽东军事思想，编写出10万余字的 《毛泽东军事思想 (摘编)》，并应约撰写过回忆朱德、贺龙、邓演达等人的革命业绩、斗争生涯的文章，为存史、资政、育人作了大量有价值的工作。

    1986年1月，经中共中央批准，李奇中重新成为一名中共党员。三年后，也就是1989年8月28日，李奇中在北京病逝，终年88岁。