（５）１９４１年１月２０日，中央军委发布重建新四军军部的命令，以华中新四军、八路军总指挥部为基础组成，任命陈毅为新四军代军长，刘少奇为政治委员，张云逸为副军长，赖传珠为参谋长，邓子恢为政治部主任。军部设在江苏盐城泰山庙，在这里驻扎约７个月。军部将活动于陇海铁路以南的八路军、新四军部队统一整编为７个师和１个独立旅，全军９万余人，继续坚持华中敌后抗战。

　　（６）１９４１年９月５日，新四军军部转移到江苏阜宁县陈集乡停翅港。村中有一个大水塘，水塘中间有一个约２亩地大的墩子，传说凤凰在这个墩子上停过翅，因而这墩子就叫凤凰墩，这个村便称停翅港。这里地形复杂，周围皆芦苇，便于隐蔽；傍倚阜淮公路，交通便捷，是个能攻能守的好地方。新四军军部在这里驻扎１年零３个月。

　　（７）１９４２年１２月２５日，新四军军部迁至江苏盱眙县黄花塘乡。黄花塘原名黄晖塘，又名黄昏塘。当地军民在开展大生产运动中，将该塘深挖，增加蓄水量，张云逸、罗炳辉提议改名黄花塘。新四军军部在黄花塘期间，代号为“黄河大队”。在此期间，军部在艰苦卓绝的条件下，指挥抗日，粉碎了日伪军的“扫荡”、“清乡”和国民党顽固派的反共摩擦、进攻，在苏、皖、浙、鄂、豫五省开辟了８个敌后抗日根据地。新四军军部在这里约２年零２个月。

　　（８）１９４５年２月２８日，新四军军部迁至江苏盱眙县东南约５０公里外的千棵柳村。千棵柳村是由卢家圩和吕家圩两个小村子组成的（今名长江村）。新四军军部在这里指挥新四军顺利进行了战略反攻以及夺取抗战最后胜利。新四军军部在这里约７个月。

　　（９）１９４５年１０月，新四军军部迁移至山东临沂城兰山路中段德国天主教堂后院。１９４６年１月７日，中央军委正式决定新四军军部兼山东军区，统一指挥山东和华中部队。新四军军长陈毅兼任山东军区司令员，饶漱石任政委，副军长张云逸兼任副司令员（４月罗炳辉任第二副军长兼第二副司令员），黎玉任副政委，陈士榘任参谋长，舒同任政治部主任。新四军军部设在此，教堂门前挂“新四军军部”、“山东军区司令部”两块牌子。新四军军部在这里约１年零２个月。

　　（１０）１９４６年１２月，新四军军部设于临沂河东区九曲镇前河湾村。前河湾村靠近沂河，对面就是临沂城。陈毅、张云逸等在此指挥了著名的宿北战役、鲁南战役、临沂阻击战，召开了华野前委扩大会议，镇压了叛匪郝鹏举等。这里是新四军军部最后一个驻地。１９４７年１月新四军改属华东野战军。