中华人民共和国成立后，李元历任军副参谋长，军参谋长，副军长兼参谋长，南京军区后勤部副部长，南京军区副参谋长，中国人民解放军总后勤部参谋长，总后勤部副部长。1964年晋升为少将军衔，获得八一勋章、二级独立自由勋章、二级解放勋章、一级红星功勋荣誉章和朝鲜民主主义人民共和国二级自由独立勋章（两枚）。1985年在中国共产党全国代表会议上被增选为中央纪律检查委员会委员。2011年1月13日，因病医治无效在北京逝世，享年94岁。

    1.南京军区政治部编研室.《征战在江淮河汉之间：新四军将士抗战回忆录选编》.解放军出版社.2005年7月
    2.中共和县县委党史研究室.《中国共产党和县地方史（1919—1949）》.安徽人民出版社.2010.10.
    3.中共巢湖市委党史和地方志研究室、巢湖市新四军历史研究室.《新四军在巢湖》.2020.10.
    4.李元.巢北烽火——回忆巢北支队的抗战历程.《新四军.回忆史料（2）》解放军出版社.2005.7.
    5.赵东云.程明远受命开辟抗日交通线.人民政协报.2020.04.09.