1946年10月，我华中野战军主力实行战略转移，北撤山东。于是，驻南通地区的国民党军队集中兵力，在如泰一带进行疯狂“清剿”，妄图消灭一分区和各县党政军机关及地方武装。特别是对如皋的河东地区、龙游河河西地区进行大规模的清剿、会剿、重点驻剿。同时，沿用老的行政建制进行反动政权统治。10月中旬，国民党集结8个团兵力北犯，28日占据东台。11月11日开始，集结2个师兵力对一分区南线4县（如皋、泰县、泰兴、靖江)进行第一期“清剿”(又称“示范清剿”)。12日，国民党第一绥靖区司令部由南通移至如皋，以7个营驻如皋城，重点实施对如皋龙游河河东地区及靖江的靖东地区“清剿”。

    在严峻形势下，中共如皋县委为加强对河东地区坚持斗争的领导，成立中共河东工委和如皋县东南行政公署，领导薛窑、白蒲、马塘、平西、车马湖5个区的敌后斗争。县委书记周泽亲率县警卫团（简称县团）一营赴河东地区坚持武装斗争，鼓舞群众斗志。后，又将一营改为河东营，同时成立河东武工队。11月17日，国民党军5个营四路合击县团驻地石庄区杨家埭，分区特务团于大王庄出兵支援，终因力量悬殊，分区特务团损失100余人，县团损失1个多连。11月19日，度军井区区委书记朱仁静等在菖蒲庵被国民党军包围。打光最后一粒子弹后，朱仁静与蜂拥而上的国民党军奋起搏斗，被扭断臂膀，胸部、颈部被戳19刀壮烈牺牲。牺牲后，他的头颅被国民党军割下悬挂在磨头大桥上。11月29日，县团在分区特务团一营的配合下，强袭石庄，俘敌40余人，缴机枪4挺。12月7日，县团一连击退由磨头向西清剿的“还乡团”，击毙“还乡团”大队长等7人，缴枪6支。这月，国民党军2个营配合还乡团1个团，对河东地区进行拉网式的“清剿”，将如皋地方武装在河东的活动范围由6个区压缩至3个乡，河东地区万名以上干部群众被迫转移到河西地区。至12月底，人民武装经历浴血苦斗后，被迫撤离河东地区。

    1947年1月，国民党军开始展开对如皋龙游河河西地区为期两个月的第二期“清剿”。为适应敌强我弱的形势，坚持斗争，中共如皋县委根据苏中一地委《告南线党员书》，决定县委干部分散到各区加强领导。河西地区各级领导紧急行动起来，进行反“清剿”动员、调整组织、精简人员、分散转移和埋藏物资。由于国民党步步为营，反复清剿，不久，河西地区解放区仅剩非常狭小的区域，出现了“一统天下三里半，七个机关颠倒转”（当时人们对解放区状况的描述）的局面，形势之严峻可见一斑。一分区主力数次深入如西地区寻求战机，均未奏效。挽救如皋危局，迫在眉睫。1947年2月16日，苏中主力部队十一纵在拼北发起攻势，歼国民党军四十九师七十九旅700余人，拔除李(堡)拼(茶)线6个据点，迫使“清剿”南线的敌四十九师抽调2个营北驰李堡增援，南线留下战略空隙。2月19日，如皋县警卫团会同一分区部队乘虚出击，发起周庄头战斗。经过激战，以伤亡30人的代价，摧毁敌13个碉堡，毙俘敌自卫队、还乡团200余人，救出被捕干部群众100多人。战后，镇压了罪恶累累的乡保长和还乡团员108人。周庄头战斗是华中野战军北移后第一次大规模的对敌进攻，也是在反“清剿”期间取得的第一次重大胜利，极大地鼓舞了如皋军民坚持敌后斗争的勇气，坚定了胜利的信心，对扭转如皋局势起了重大作用。

    周庄头战斗后，中共如皋县委扩大战果，恢复河东营、河东工委和东南行署，再次进入河东地区。国民党军一、二期清剿未能实现消灭中共地方武装的目的。3月3日开始，纠集1万余兵力对如皋河西地区和两泰（泰兴、泰县）实施“三月会剿”（也称“血洗清剿”），公开推行“宁可借杀一千，不可漏网一个”，并编保甲，筑据点，使如皋境内的国民党军碉堡增至1570多个。面对国民党军的白色恐怖，如皋军民，英勇不届，与敌周旋。于是，国民党军又实施在如皋的“四月清剿”（也称重点清剿、第四期清剿）。如皋县警卫团及各区游击队多次出击，攻克国民党军多个据点，收复吴家窑，逐步打开石庄、度军井2区局面，还重新组建警卫团三连。国民党军第四期清剿不了了之。

    1947年5月，是如皋解放区坚持敌后斗争最为尖锐的1个月。5月1日起，国民党增调1个旅进驻如皋，使进剿如皋解放区的国民党总兵力达到1.5万人，并开始实施5月“硬性清剿”计划，企图“会剿”“搜剿”“驻剿”相结合，在月内彻底摧垮解放区武装力量和基层政权。如皋军民为打破国民党“硬性清剿”计划，在加强组织建设的同时，频繁出击。5月15日，如皋县警卫团攻克敌谢庄据点。17日，痛歼国民党钱家庄自卫队。20日，又与度军井游击队配合击溃下乡抢粮的磨头守敌。28日，袭击如新线敌运输汽车。与此同时，全县各区乡组织地方剧团演出话剧《还乡梦》，进一步坚定解放区广大干群坚持斗争的决心。

    国民党5月“硬性清剿”没有达到预期目的，又于6月1日起开始实施“延期清剿”。6月4日，如皋县团在珊瑚庄袭击增援被分区支队围攻夸子庄据点的国民党军，歼敌90余人，缴重、轻机枪4挺、步枪60支。6日，城东地区地方武装伏击自雪岸出动的敌军，俘四十九师辎重营工兵13人，缴轻机枪2挺、步枪12支。7日，又于夏家圩、苏庄一带击溃下乡抢掠的丁堰敌军2个连。11日，卢港区游击队于卢庄乡3次击败抢粮的土顽。16日，江安区游击队在南小庄毙敌6名。28日，如皋县团配合白蒲、薛窑等区武工队突入国民党占领7个月之久的河东三角地区，在沈广富庄捕获并严惩了倒粮倒田的反动地主及顽固分子多名。同时，度军井区2000余群众，将如新线两侧5千多米的封锁墙全部平毁，并击毁敌汽车2辆，收割大量电话线。人民地方武装和民兵节节阻击，搞得敌军疲于奔命、处处被动，国民党的“延期清剿”计划又告失败。