朱璧钦被抓后，威风凛凛，不肯低头认罪。此时的黄石生也有了自己的想法：目前正是抗日战争的关健时刻，也是国家需要人才的时候，朱璧钦一表人才，有勇有谋，又有一支队伍和大批武器，何不收归自己所用？不打算枪毙朱璧钦，准备关押一段时间后再给予释放。

    得知黄石生不打算枪杀朱璧钦，当地几位对朱璧钦有意见的乡绅以“欺男霸女，草菅人命”、“放朱璧钦就是放虎归山”、“不杀朱璧钦不足以平民愤”为由，再次联名上书黄石生，要求枪毙朱璧钦，以儆效尤。

    1942年11月18日，无可奈何的黄石生只好以“通共”为名，下令将朱璧钦枪杀于武宁泉口枣源。

    朱璧钦被枪毙后，其领导的朱湾自卫大队也遭到了国民党瑞昌县政府清算，队伍收编的收编，解散的解散，武器全部被收缴。从此，朱湾自卫大队不复存在。