1945年抗战胜利后李清海调到二师卫生部一分所任所长，后随部从淮南、京浦路东开拔到山东。1946年下半年李清海到新四军卫生部医务干部训练队学习，毕业后派到山东，在胶东军区成立十三纵队任三十九师卫生处长。李清海在山东参加解放滕县枣庄，莱芜战役、衮州战役、济南战役、淮海战役等。部队渡江战役前改为十兵团第31军，李清海先任师后勤处处长，后调军区卫生处处长。参加渡江战役、上海战役，最后随部队南下参加进军福建、解放福州和厦门等战役。

    1953年李清海由31军调回南京军区第十一陆军医院任院长，1954年8月调第二军医大学习，1958年毕业后分配到浙江省军区军医院任院长，先后又任省军区后勤部副部长和后勤部部长等职。1955年被授予三级八一勋章、三级独立自由勋章、三级解放勋章。1982年底离职休养，享受副军待遇。1988年被授予二级红星功勋荣誉章。