1959年7月，邓华以莫须有的罪名被扣上了彭、黄反党集团“军事俱乐部成员”的帽子，被错误地撤销了党内外职务并转业地方，离开了他战斗多年的军队。“文革”之初，邓华又受到了残酷批斗，被关进“牛棚”。

    1977年8月，邓华重新回到军队，出任军事科学院副院长、中央军委委员。回到北京后，中央军委问他还有什么要求，邓华提到了洪学智。邓华与洪学智是老战友、老搭档，邓华担任辽北军区司令员时，洪是副司令员。以后，部队南下作战，邓是15兵团司令员，洪是第一副司令员，他们曾朝夕相处，感情很深。庐山会议后，洪学智也受到了牵连，被下放到吉林省当重工业厅厅长。近二十年来，邓华心中一直对他怀着深深的歉意。当年，要不是将他要到志愿军总部来，他肯定不会遭此厄运。邓华随即同几位同志商量后，向中央军委领导呼吁：“一定也要把洪学智弄回部队！”很快，中央军委领导便接受了这个建议。见面后，邓华含着热泪，紧紧握着洪学智的手：“昨天才提出建议，没想到你今天就回部队了！”洪学智也动情地说：“咱俩要好好喝一杯啊！”邓华和洪学智一起谈话时，话题总是离不开部队和打仗。邓华说：“要下决心抓飞机啊！在朝鲜战场，咱们是光着脑袋打仗啊，对作战很不利，现代化战争没有制空权不行啊！”洪学智则安慰他说：“好了，好了，你安心养病吧。等病好了，咱们再打仗。”这时，邓华已年近七旬，身体状况很差，但他毫无懈怠，责任感依然那么强烈。一天，他要上一山头看地形，但是上不去，警卫员和司机便用一只凳子抬他，抬到无法抬了，他便坚持要自己上，跟随多年的老司机看着心疼，就把邓华背上了山顶。邓华摊开地图，举目观察，像是又上了前线。邓华这种锲而不舍的精神，不能不让人赞叹。

    1980年3月20日，解放军总政治部向中央军委和党中央提交了关于“邓华问题”复查的结论报告，中共中央和中央军委批准了这个报告。解放军总政治部于同年５月７日向全军发出了《关于邓华同志问题复查结论的通知》。就在当年5月，邓华从广州返回北京途经上海停留，因感冒导致肺气肿发作又引起并发症，病情很快恶化。7月3日，邓华在上海与世长辞。

    2005年10月5日，新华社在《永远的丰碑》栏目以“南征北战勇无敌”为题播出了邓华的革命功绩。