因为相似的经历，朱元璋十分崇敬舜帝，曾亲自撰写《祭陵祝文》：

    “朕生在后世，为黎民于草野之间。当有元失驭，天下纷纭，乃乘群雄大乱之秋，集众用武。荷皇天后土眷佑，遂平暴乱，以有天下，主宰庶民，今已四年矣。君生前世，作烝民主，大德无穷，垂法至今，后人不忘者，以其量同天地故也。朕典百神之祀，考君陵墓在此，然相去三千余年，观于帝典，大哉圣德，非天者何？虽窃慕于心，奈禀性之愚，时有古今，民俗亦异，仰惟圣谟，万世所法。特遣专官，祭祀修陵，圣灵不昧，尚祈鉴纳。”

    清代把祭舜活动推向了一个新的高潮，成为历史上祭舜活动最多的王朝。因为是少数民族建方起来的大统一封建王朝，为了巩固自己的统治，笼络占全国人口百分之八十五以上的汉民族之民心，必须认同和接受汉民族文化，特别是以舜文化为源头的儒家文化，除了尊崇汉民族的先哲先贤——从三皇五帝到孔孟之徒，此外别无选择。因此，祭祀汉民族先哲先贤的仪式必不可少。顺治帝是清王朝第一位遣官到九嶷山祭舜的皇帝，在顺治八年（1651）遣侍读学士白谦允到九嶷山致祭。此后，康熙六年（1667）遣宗人府丞高珩至九嶷山致祭，告亲政。康熙十一年遣督理事官魏双凤致祭，告平定三藩。凡遇大事，必遣官致祭。康熙朝，遣官致祭达九次之多。

    从康熙到宣统等十一位皇帝，无一例外都遣官致祭九嶷山舜帝陵。据记载，清王朝12位皇帝一共遣官45次之多。在清王朝中，遣官致祭次数最多的是乾隆，达12次。清王朝最后一位皇帝——宣统，也于宣统元年（1909年），派遣永州镇总兵张庆云到九嶷山祭舜，报告宣统皇帝即位事。这次祭舜，也为中国帝王祭祀舜帝画上了句号，成为中国历史上帝王祭舜之绝唱。据不完全统计，至今保存下来的历代朝廷遣官祭舜帝文共有58篇。

    至现代，由中央政府直接派员到九嶷山祭祀舜帝的情况基本中断，但作为地方政府和地方官员以及民间的祭舜活动仍然在进行。民国二十八年（1939）到民国三十一年（1942），湖南省政府主席薛岳曾四次祭舜，一年一祭。

    中华人民共和国成立以后，零星的、小规模的祭舜活动虽然从未间断，但是由政府组织的正式祭舜活动，始于2000年清明节。由宁远县人民政府组织社会各界，举行祭舜典礼。此后，2000年9月9日，永州市人民政府组织社会各界举办了一次规模空前的祭舜大典，参加大典各界代表达3000余人，还有3万余名群众随祭。2005年9月15日，2009年9月8日，2012年9月28日，2015年9月22日，2018年10月26日，2022年9月7日，湖南省人民政府六次举办公祭舜帝大典。

    规模最大的民间社团祭舜，当数2004年9月15日由湖南省九嶷山舜帝陵基金会、世界舜裔宗亲联谊会联合举办的甲申年祭舜大典，参加这次祭舜大典的主祭人、陪祭和各界群众共6万余人。这次祭舜大典，在世界各国与地区的舜裔中产生了重大而深远的影响。泰国总理他信给祭舜大典发来了贺电，泰国执政党泰爱泰党副主席、泰国舜裔宗亲总会主席陈保焜也发来贺电。旅居国外的华裔，特别是舜裔宗亲，慎终追远，寻根祭祖，使舜文化在世界范围内得到广泛传播，并发扬光大，中华民族的凝聚力得到进一步增强。