党为了领导人民继续进行革命活动，各机关团体被迫转移到前岭南岸一带。县委成立后，一方面领导游击队常常扰乱敌人后方，一方面继续在那里建立新的苏维埃政权。不久，就以南岸为据点，建立了南岸、官陂、双江、牛田四个区委，并且经常深入到白区宣传革命的好处，帮助建立村政府。这时大部分地区被敌人占领，钱粮、给养等问题，发生了极大的困难。有些同志找不到饭吃，就吃野菜充饥，甚至一连几天都找不到东西吃。可是，很多共产党员在这些困难面前，仍然坚持斗争。

    6月3日，各级政府都潜伏在山上继续作斗争，每区都组织游击队，加上吉泰独立营，进行了艰苦卓绝的游击战争。从6月到8月，叫作打游击时期，相互没有联络，得不到任何援助，敌人不时地搜山、烧山、引诱、威赫、捉墩家属、亲友，实行各种封锁。革命同志用种种方法，克服困难，戴平昌说，我们白天背着枪在山上休息，夜晚突击敌人，向堡垒射击扰乱敌人。

    一个晚上转移七次，使敌人捉摸不透，由于人民爱护自己的游击队，为游击队送油盐柴米、带路通讯、打听消息，使得游击队得到了支援。谢元吉等时常帮助游击队，虽然反动派打他、罚他，说他勾匪、窝匪，他对游击队的支援仍然没有停止。游击队与群众的密切结合，坚决开展反投降斗争，县委书记彭清声叛变并带反动派搜山，游击队及于夜晚包围竹山村其家，未捉到彭，随手杀其父、弟、妻3人。游击队没有子弹，他们用玻璃瓶子装沙土和炮药，作大炮用，把弹壳珍藏起来装沙土炮药当子弹继续地用几次，得不到饭吃，游击队就吃芋头、青菜几天，许多同志在战斗中被捉，有的叛变了。于是，把游击队编为独立营，撤到永新后，官田地方的军事斗争基本结束。此后，就潜伏在山上，以便与上级取得联系。此时的状态是，或躲在山上，或潜入百姓家中，或散藏起来，叫作“打埋伏”时期。

    7月4日，肖克、王震率领湘赣苏区主力红军红六军团十七师、十八师也来到牛田。肖克、王震等军团领导人驻牛田街上生茂号货栈，全军团8000多人，分别驻扎在自金鸡石下至牛田村，方圆10多华里的村庄里。同月，吉安县南岸村来了一支部队，并驻扎下来，这支部队叫“湘赣省吉泰县游击大队”。同时，来到村里驻扎下来的还有很多机关，一共有省、县、乡18个，2000多人。基本上把村落住满了。18个单位为湘赣省政府、吉泰县政府、兵工厂、吉泰游击队、组织部、裁判部、宣传部、政治部、军事部、共青团、妇女会、难民团、六区政府、商店、医院、礼溪乡政府、肃反部、财贸部。村祠堂驻湘赣省苏维埃政府、吉泰县政府、吉泰游击大队、省财政部，尹德善家驻暗杀团，尹炳基家驻裁判部，尹金民家驻肃反部，尹秀元家驻医院，尹介福家驻枪炮队，尹忠宝家驻商店。还在糯米坑设立红军后方医院。在南岸村的周围，现在都还能看得到战壕、碉堡等痕迹。村里的大祠堂，以前请原国家主席董必武写过对联，可惜后来遭破坏毁了，只留下残迹。

    为支援红六军团西征，吉泰县党委、政府组织干部群众筹备各种物资，保障后勤。在供给部部长徐杰领导下，供给部依靠吉泰县等地方党组织和人民群众，筹集粮食（大米）14万斤，每个战士有干粮30斤。修理枪械，补充弹药，以连为单位检查所有枪支，7天内检修完毕；赶造一批手榴弹、大刀，造了子弹15万发。采集西药和草药，地下交通站派员深入敌占区采购所需的药品与器械；动员战士上山采集各种草药。准备雨具、草鞋，规定每个战士必备一件雨具；规定每个战士打草鞋5双以上。动员妇女为红军战士辗米做干粮、洗衣、缝补衣物。妥善安置了伤病员，首先以连为单位做好调查摸底，编制名册上报军团部，最后将60多位重伤员安置在吉泰县当地群众家。

    红六军团从吉泰县牛田出发，西征北上后，国民党反动派军队趁我红军北上抗日之机，调集了大批反动军队，向永阳、敖城、官田一带进攻。根据地迅速缩小，吉泰游击队转移至官田梅花山、水源一带坚持斗争。后转移至安福武功山坚持三年游击战争。

    同年12月，由于国民党军的烧杀掳掠，经济封锁，中共湘赣省吉泰县委、县苏维埃政府被迫解体。