纪念馆位于广州市黄埔区长洲岛内,该岛正是黄埔军校的所在地,拥有东征阵亡烈士墓园、北伐纪念碑、长洲炮台等人文历史遗迹。纪念馆于2009年12月29日奠基,总建筑面积为18000平方米,包括陈列区13200平方米,藏品库区1000平方米,技术及业务用房1800平方米,观众服务及配套设施2000平方米。
辛亥革命纪念馆完工后将和长洲岛、黄花岗烈士陵园、广州起义旧址纪念馆等形成展示中国近代革命历史历程的建筑群。