1950年7月,父亲调入中央,任中华全国合作社联合总社副主任,除负责管理供销合作社和消费合作社外,也负责管理手工业生产合作社的工作(1955年手工业生产合作社从供销合作社分出,单独建立了全国手工业生产合作总社)。父亲领导了五年的手工业合作化工作,至1955年底,全国手工业生产合作社(组)发展到6.4万多个,社(组)员220多万人。1956年实现了手工业的社会主义改造。1983年11月全国手工业合作总社理事会扩大会议召开,父亲作为一个老的合作社工作者,将新中国成立初期的情况向与会同志们作了介绍。
在新中国经济建设中,父亲保持着调查研究和走群众路线的传统。1951年12月,总社向中财委陈云主任并党中央写了《关于合作社收棉工作的经验总结报告》,毛主席很快作了批示,肯定了父亲的想法。从此,合作社逐渐担负了棉花、烤烟、工业用麻、蚕茧、蚕丝、羊毛、茶叶等重要农副产品代国家全部收购的任务。
1955年春天,中央调查部部长罗青长打电话给父亲说:“毛主席很关心供销合作总社工作,让你们在中南海搞个展览。”展览地点设在中南海瀛台的大殿里,4月6日夜间毛主席叫我父亲陪他观看全国供销合作总社展览。毛主席对统计图表、照片、文件、实物都很感兴趣,问这问那,这件事对父亲的启发很大,也给了供销社的同志们极大的鼓舞。

1955年4月6日,程子华(右一)陪同毛泽东参观全国供销合作总社展览
1956年8月,父亲任国务院财贸办公室副主任;1958年9月,任商业部部长、党组书记;1960年2月,任国家基本建设委员会常务副主任、党组副书记,协助陈云同志工作;1961年1月,任国家计委常务副主任、党组副书记,协助李富春同志工作。
1963年,周恩来总理要求,解决香港人民吃水困难问题。父亲经与陶铸同志商量并报李富春同志,立即将供水工程列入了国家计划,将东江水经过几级提升,越过高山,输往香港,从而解决了香港人民的吃水困难。
1965年2月,父亲正式任西南三线建设委员会常务副主任,并兼任西南局书记处书记,主抓三线工程。西南三线基地建设的工作和生活都异常艰苦。按照毛主席“靠山、近水、扎大营”的指示,选的点大多在边远山区的崇山峻岭之中,只能徒步行走,跋山涉水才能到达。有的地方即使有简易公路,也处在高山悬崖之间,地势十分险要。
1964年5月,父亲第一次踏上攀枝花这片土地,从此就与三线建设结下了不解的情缘。从和平建设到准备应对战争,久违的革命任务又点燃了父亲胸中无尽的激情,仿佛是又一次征程的集结号。父亲当时虽然已是年近60岁的人了,战争年代双手又留下了残疾,但是他几乎踏遍了云、贵、川三省交界的大多数山地,他说再困难也没有长征困难。
“文化大革命”期间,父亲又重新学习了马克思的《资本论》、列宁的《俄国资本主义的发展》,着重学习了毛泽东的《实践论》《矛盾论》,并用一年半时间,写出了长达万言的《关于西南三线建设的报告》,这是一份十分珍贵的史料,周总理给予了高度评价。
1978年3月,父亲任民政部部长、党组书记。1978年9月16日,第七次全国民政工作会议召开,这是原内务部撤销十年后首次召开全国民政工作会议。1979年下半年,父亲前往浙江蹲点,进行县级人大代表直接选举试点工作,为全国开展基层选举工作提供了宝贵经验。1979年11月21日,民政部在北京召开全国人事局长会议,父亲主持会议并致开幕词。1980年2月7日,父亲在第五届全国人大常委会第十三次会议上作《关于全国进行县级直接选举试点工作情况和今后选举工作布置的汇报》。4月10日,根据中央书记处指示,父亲任全国县级直接选举办公室主任。

1981年9月18日,程子华在河北省张家口留影

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