1957年甘祖昌申请回乡后，国家按规定给予他适当的待遇。在农村的二十九年里，甘祖昌同志经常深入实际，调查研究，密切联系群众，与群众同甘共苦，一直坚持参加劳动，修建了3座水库、25公里长的渠道、4座水电站、3条公路、12座桥梁。甘祖昌回乡后，组织上照发给甘祖昌薪金，据统计，1957年至1984年间，甘祖昌工资收入加原有存款共计102452元，其中支付用于国家建设的有79032元，占总收入的百分之七十多。为促进家乡的经济发展作出了很大贡献。
甘祖昌是党的第九次全国代表大会代表，第三、四届全国人大代表，第五届全国人民代表大会常务委员会委员，江西省第四届政协委员副主席。