1997年8月11日，由王选率领的侵华日军细菌战中国受害诉讼原告团，在日本律师团和日本和平友好人士的支持下，就日本细菌战罪行向日本法院提出赔偿诉讼。衢州市域有14位细菌战受害者代表参与其中，杨大方、吴方根、吴世根、冯雪娜等4名衢州细菌战受害代表和专家证人邱明轩曾先后赶赴东京法院出庭诉讼。在长达10多年的调查与诉讼过程中，诉讼团的成员们收集、提供了大量的日军细菌战罪证，使日本法院作出了确认日本细菌战犯罪事实和国家责任的判决。除了在日本法庭上与日本政府交锋，吴世根还在中外媒体和记者和专家学者乃至联合国专家面前，揭露和控诉日本细菌战罪行。在吴世根生命的最后时光，他还以病弱的躯体亲自参与、成功地创建了侵华日军细菌战衢州展览馆。他的最后一次接受采访，是在上个月王选陪同的日本ABC企划委员会访华团来衢访问时，要求矢口仁也团长向日本转达细菌战受害者的心声：“中国人民是爱好和平的，也是用实际行动来维护和平的，细菌战诉讼的官司打了十几年，希望有朝一日日本政府能够谢罪和进行经济赔偿。”