1940年（27岁）
　　1月21日，向陕甘宁边区政府呈报《关于关中分区的反磨擦问题》的报告。
　　3月，在关中分区回民抗日救国分会成立大会上讲话。
　　5月8日，向陕甘宁边区政府呈报《关中分区反磨擦斗争的总策略》的报告。
　　10月，出席陕甘宁边区县长联席会议。

　　1941年（28岁）
　　4月，任中共陕西省委委员。
　　7月，在新正县第二届参议会第一次会议上作政府工作报告。
　　8月27日，任关中分区警备司令部政治委员。

　　1942年（29岁）
　　8月，任中共西北局党校校长。
　　10月19日，出席西北局召开的边区高级干部会议。

　　1943年（30岁）
　　1月14日，在西北局高干会议闭幕会上，西北局隆重奖励习仲勋等22名领导生产有卓越功绩的干部。毛泽东为受奖同志题词，给习仲勋的题词是：“党的利益在第一位。”　　
　　2月，任中共绥德地委书记。
　　3月，兼任绥德警备区和八路军第一二0师独立第一旅政治委员。
　　10月14日，参加陕甘宁边区第三次高干会议。
　　12月，出席陕甘宁边区军、政、民劳动英雄模范大会。

　　1944年（31岁）
　　在绥德分区发动群众开展大生产，自力更生，战胜困难。发现、培养了劳模刘玉厚，树立了郝家桥模范村典型，使之成为陕甘宁边区的生产模范。
　　在全分区施行“三三”制的原则，加强了各级政权建设。
　　在整党和审干中，抵制和纠正“左”的偏向，保护了干部和群众。
　　11月5日，在延安《解放日报》发表文章：《贯彻司法工作的正确方向》。

　　1945年（32岁）
　　4月23日至6月11日，出席中共第七次全国代表大会，当选为候补中央委员。
　　7月11日，在中共西北历史问题座谈会上作《关于渭北苏区》的发言。
　　7月，任南线临时指挥部政治委员，和司令员张宗逊指挥部队取得了爷台山反击战的胜利。
　　8月，任中共中央组织部副部长。
　　10月，主持中共西北局工作。
　　11月，任陕甘宁晋绥联防军代政治委员，王世泰任代司令员。

　　1946年（33岁）
　　3月8日，在边区纪念三八国际妇女节大会上作《贯彻边区妇女运动的正确方针》的讲话。
　　4月2日，在陕甘宁边区第三届参议会第一次会议上当选为常驻议员。
　　6月，任中共西北局书记。
　　8月19日，按毛泽东关于策应中原突围的王震三五九旅返回边区的指示，和王世泰组织了南线出击。王震率部29日返回陕甘宁边区。
　　8月底毛泽东找习仲勋、王世泰谈话，介绍苏中七战七捷的战例，勉励习、王学会集中优势兵力打歼灭战。
　　10月，组织策动了胡景铎率国民党陕北团队起义。
　　11月13日，在陕甘宁边区机关干部运动大会上作保卫边区、保卫延安的战备动员报告。
　　12月16日，和彭德怀受党中央委托，到山西离石县高家沟主持召开陕甘宁、晋绥两区联防作战会议。

　　1947年（34岁）
　　2月10日，任陕甘宁野战集团军政治委员，和司令员张宗逊率部出击陇东。
　　3月7日，在国民党军加紧准备进犯延安的形势下，和林伯渠、王世泰等向全边区发布戒严令。
　　3月16日，毛泽东发布保卫延安命令，边区部队区分为野战兵团和地方兵团，“上述各兵团及边区一切部队，自3月17日起统归彭德怀、习仲勋同志指挥”。
　　3月19日，和彭德怀率西北野战军撤出延安，准备诱敌深入，集中兵力各个歼灭。
　　3月21日，中共西北局发出《广泛开展游击战争，坚持根据地斗争》的指示。
　　3月25日，协助彭德怀指挥青化砭战役，歼敌第三十一旅2900余人，俘其少将旅长。
　　3月28日，毛泽东致电贺龙、李井泉并告彭德怀、习仲勋：“中央率数万人在陕北不动，这里人民、地势均好，甚为安全，目前重要敌人是胡宗南，只要打破此敌，即可改变局面，而打破此敌是可能的。”
　　4月14日，协助彭德怀指挥羊马河战役，歼敌第一三五旅4700余人，俘少将代旅长。
　　4月15日，毛泽东致电彭德怀、贺龙、习仲勋，作《关于西北战场的作战方针》的指示。
　　5月2日至4日，协助彭德怀指挥蟠龙战役，歼敌整编第一六七旅6700余人，俘少将旅长，缴获大批武器、装备和给养。
　　5月13日、14日，和周恩来、彭德怀、陆定一在安塞马家沟商定6月份作战计划。
　　5月14日，在安塞县真武洞召开的边区军民庆祝三战三捷大会上讲话。
　　5月21日至7月7日，和彭德怀率西北野战军进行了陇东三边战役，歼敌4700余人，收复了环县、定边、安边、靖边等地。
　　7月21日至23日，出席中共中央在靖边县小河村召开的前委扩大会议。会议研究了解放战争第二年作战的基本任务、方针和加强西北战场的措施。
　　7月31日，任中共西北野战军前委委员、西北野战军副政治委员。
　　7月底，任陕甘宁晋绥联防军政治委员、党委副书记。小河会议后回西北局主持工作。
　　8月，和贺龙、林伯渠、王维舟联名发布《关于统一河防的训令》。
　　9月3日，和彭德怀、徐立清联名发出严整各兵团纪律的电令。9月23日，中央军委指示贺龙、习仲勋，为保证作战时供应不缺，要求立即动员出2万石（1石合120斤）细粮，并集中新兵5000至10000人加入野战军；全部棉衣、鞋袜应在20天内送达。
　　10月24日，和贺龙报告中央军委及彭德怀等，已准备棉衣6.5万套、棉鞋16万双、棉被2500床，月底前完成并送前线。

　　10月30日，和贺龙致电彭德怀，野战军30天共需粮1.2万石，目前已筹到1.5万石。另为野战军冬季整训准备粮食1.4万石。
　　11月1日至25日，在绥德义合镇主持召开西北局会议，传达贯彻全国土地会议精神和《中国土地法大纲》。
　　和贺龙、林伯渠派绥蒙军区副政委张达志带两个骑兵团分赴关中、晋南，为西北野战军筹措冬季所需的衣、食、钱。至1948年2月，张达志圆满完成此项任务。
　　12月11日，和贺龙报告中央军委并转彭德怀，已给野战军补充新兵1万人，并提出新兵分配方案。
　　12月8日至28日，出席中共中央在米脂县杨家沟召开的重要会议。会议期间受到毛泽东接见。
　　12月，和林伯渠、贺龙联名发出布告，号召全边区人民坚决贯彻执行中共中央颁布的《中国土地法大纲》，彻底完成土地改革。
　　12月，与贺龙主持召开西北局会议，研究部署救灾粮的转动工作。冬，参与领导西北野战军和陕甘宁晋绥联防军开展新式整军运动。