闽台缘博物馆从筹建到开馆，都得到了台湾同胞的大力支持和鼎力相助。开馆以来，台湾人士向博物馆捐献文物20多件，其中有珍贵的家书、家传文物、历史文献以及台湾原住民的相关资料。洪先生特地从岛内带来原住民雕有蛇图腾的陶罐；鹿港天后宫捐赠了妈祖神袍；张先生将珍藏多年的民国时代的彩扎捐献出来；台湾著名锡雕大师陈万能特地创作锡雕作品《居家和乐》赠送给闽台缘博物馆。

　　闽台一家亲，两岸脉相连。杨彦杰表示，闽台缘博物馆已成为收藏闽台历史记忆的殿堂、展示闽台渊源的窗口、研究两岸关系的基地、加强两岸交流的平台、青少年爱国主义教育的课堂。相信在两岸人民的共同努力下，闽台缘博物馆将成为两岸交流、合作的推动者、见证者，为加快建设两岸人民交流合作的先行区作出贡献。