在当时的形势下，铁血军在白天活动十分困难，只能在夜里行军。6月13日晚，苗可秀率部由凤城渡大洋河向岫岩方向移动至羊角沟。被村中汉奸告密，日伪军深夜赶至，与苗可秀发生战斗。在撤退途中，苗可秀臀部被炮弹炸伤。为了不拖累部队，他让战友们先撤，自己和几个负伤战士在山林中养伤。苗可秀的伤势日渐严重，几经周折，他们找到一位医生，但没有药，医生也没有办法，最后医生答应可以帮助进城买点药。不幸的是，这位医生被敌人逮捕，后经不住严刑拷打，说出了苗可秀的藏身地。日伪随即开始大规模搜捕。几位受伤的战士抬着苗可秀迅速转移，但被敌人发现，不幸被捕。

    苗可秀被捕后，被敌人押解到凤城，关在车站日本警察署的地下室里。敌人企图诱降苗可秀，都被苗可秀凛然回绝。苗可秀的民族气节感动了日本翻译官前山。他不止一次地向苗可秀表达敬佩之意，还私下对苗可秀说，应抓紧时间给家人朋友写信，如果信任的话，他愿意代为传递。前山果不食言，先后代为转邮了两封书信，其中一封是写给东北民众抗日救国会王卓然、卢广绩、阎宝航、车向忱等负责人的，另一封是写给同窗好友张亚轩、宋忱(宋黎)的。在信中给儿子起名“苗抗生”，勉励儿子继承父亲遗志，为抗日而战斗终生，还拜托老师收养不知流亡何处的妻儿。他嘱咐同志，为抗战到底“当益努力”，并托他们为他“在西山购置一卧牛之地，为余营一衣冠冢”，并说:“凡国有可庆之事，弟亦当为文告我。”

    1935年7月25日，苗可秀英勇就义，牺牲时年仅30岁。