澳门海事博物馆座落在当年首批葡萄牙人登岸的地方，于1990年6月建成投入使用，该馆由博物馆大楼和馆外广场两部分组成。博物馆的外形好像一艘独特的船，停泊在渔民聚居的内港入口处，它洁白的外墙彷如一艘三桅船张开的帆，它的玻璃窗令人联想起一个一个的瞭望台。

    博物馆内分设了“渔民天地”、“海上贸易”、“航海技术与交通”、“水族馆”等几个展区，另在地下和一楼之间的阁楼陈列了十四艘葡国传统船只模型。

    渔民天地展区主要介绍中国南部渔民群体的情况，着重介绍澳门渔民的传统。最引人注目的就是“妈阁庙的故事”，是通过四幕活动舞台情景，把有关天后的故事演绎出来。游客可自行选择合适的语言作为旁述：葡语、粤语、普通话及英语。

    海上贸易展区把当年航海大发现的旅程重新展现在人们的眼前，诉说着东西方的航海历史。展品有商业贸易——包括茶叶、香料、丝绸和瓷器等一些大发现时期的主要贸易品；葡国大帆船及大商船的模型；十五及十六世纪期间葡葡牙人航海大发现的路线图等。

    航海技术与交通展区陈列着与航海技术及交通工具有关的展品，东望洋灯塔模型，捆绳器及各种绳缆，展示木桨的制造过程等等。

    水族馆展区内设有四个水族箱，各代表着不同的水底世界，让游客观赏到各种鱼类。第一个箱是唯一的淡水馆，展现一条河床；第二个箱令人联想到某个海港的水域；第三个是珊瑚礁；第四个重组了一艘沉船所在的深海区的情形。

    馆外及广场：昔日的一号码头已被列作博物馆的设施成为休闲场所，一号码头内安放着一些摆设，较为突出是一艘龙舟，与目前每年龙舟竞渡时所使用的一样。还有两艘帆船停泊在码头内，每天航行在内港及南湾一带。广场由一幅大帐幕遮盖，人们可从这里观赏河岸的景色以及繁忙的海港，又或者看一看不断有游客走向妈阁庙的情形。

    博物馆由内至外充满着大海的气息，通过声、光、像等科技设备，把游客带入海的世界，从而充分系统地展示了澳门特区以及中国和葡萄牙在海事方面的历史。